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研究人员通过检查病人的基因找到了改善癌症预后的方法

研究人员通过检查病人的基因找到了改善癌症预后的方法

通过挖掘大量基因数据,弗吉尼亚大学医学院(University of Virginia School of Medicine)的研究人员正在提高医生治疗癌症的能力,预测病人的预后,并确定哪种治疗方法对个别病人最有效。

研究人员已经确认了我们基因中的遗传变异,这些变异会影响病人在诊断后和治疗期间的表现。有了这些信息,医生将能够检查病人的基因构成,从而提供真正个性化的药物。

“肿瘤学家可以根据肿瘤的等级、分期、患者的年龄、肿瘤的类型等来估计患者的情况。我们发现[添加一个基因预测因子]可以提高我们5%到10%的预测能力,”弗吉尼亚大学的Anindya Dutta博士说。“许多癌症都有可预测结果的多重遗传基因变化,所以如果我们把这些加进来,而不是增加10%,我们可能会增加30%的能力来准确预测患者将如何使用我们目前的治疗。这是令人惊叹的。”

弗吉尼亚大学生物化学和分子遗传学系主任Dutta认为,检查病人的遗传基因组成,可以为预测结果和选择治疗方法提供类似的好处,这些治疗方法适用于许多其他疾病,从糖尿病到心脏病。因此,这一方法代表着医生们在针对个人需求和基因构成量身定制治疗方面迈出的重要一步。

为什么有些病人比其他人好

这项研究为长期困扰医生的问题提供了答案。“每个临床医生都有这样的经历:两个癌症患者来到这里,他们有着完全相同的癌症——相同的等级,相同的阶段,接受了相同的治疗。其中一个做得很好,另一个做得不好,”Dutta说。“一直以来的假设是,关于这两个人,有一些我们不了解的东西,就像可能有一些肿瘤特异性突变,一个病人有,而另一个没有。但我们意识到,有了这些基因组数据,我们可以验证另一种假设。”

为了确定病人的基因差异是否是答案,Dutta和他的同事们深入研究了癌症基因组图谱,这是由美国国立卫生研究院的国家癌症研究所收集的一个巨大的遗传信息宝库。研究人员试图将遗传基因变异与患者的预后联系起来。

“这个聪明得令人难以置信的博士研究生,Ajay Chatrath先生,认为现在是探索这个问题的最佳时机,”Dutta回忆说。“在UVA云计算服务的帮助下,我们设法下载了所有这些基因组测序数据,并识别出所谓的生殖系变异——不仅是肿瘤特异性突变,还有从父母那里遗传而来的突变,这些突变存在于患者的所有细胞中。”

研究人员开始时规模很小,但很快就意识到这项工作可以做得有多快,效益有多大。“一旦我们意识到这是一件非常容易的事情。我们接着做了所有33种癌症和所有1万名病人,又花了6个月的时间,”Dutta说。“所有这一切完美地结合在一起。实验室里的每一位成员都对分析做出了贡献,这是非常令人兴奋的。”

Dutta渴望分享他的发现,希望能找到合作伙伴,激励研究人员和私营企业开始挖掘其他条件下的数据。“这是一个非常容易摘到的果实,”他说。“生殖系变异预测结果可以适用于所有类型的疾病,不仅仅是癌症,而且(它们可以预测)对所有类型的治疗的反应性,这就是为什么我特别兴奋的原因。”

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