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研究小组开启了理解SARS-CoV-2变种的新方法

研究小组开启了理解SARS-CoV-2变种的新方法

来自澳大利亚国家科学机构CSIRO的研究人员公布了一种分析导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒遗传密码或蓝图的新方法。

分析这种新型冠状病毒已发表的基因组序列的全球数据,将有助于我们快速了解这种复杂疾病。

研究人员开发了一种新的可视化平台,以最初用于分析人类基因组的生物信息学算法为基础,以查明SARS-CoV-2病毒的数千个基因序列之间的差异。

CSIRO首席执行官拉里·马歇尔博士表示,了解基因密码至关重要。

马歇尔博士说:“我们对这种病毒了解得越多,我们就能更好地对付它。”

“对SARS-CoV-2病毒基因组序列的这种高度复杂的分析,已经帮助确定了哪些病毒株适合用于正在进行的疫苗测试。这些疫苗目前在位于基伦的澳大利亚疾病预防中心(Australian Centre for Disease防备)进行,该中心是南半球唯一的高生物遏制设施。”

CSIRO生物信息学小组组长丹尼斯·鲍尔博士说,随着病毒的进化,这一蓝图变得越来越重要,因为它有效地掌握了关于病毒行为和它会导致何种疾病的指令。

“全球现在有大量的单个病毒序列,”鲍尔博士说,他同时也是澳大利亚麦考瑞大学的名誉副教授。

“评估这些数据点之间的进化距离,并将其可视化,有助于研究人员了解病毒的不同菌株——包括它们来自哪里,以及它们如何继续进化。”

CSIRO的危险病原体组长党卫军Vasan教授是谁领导SARS-CoV-2病毒和疫苗评价研究工作和论文的通讯作者,说第一个181年出版的基因组序列从当前COVID-19疫情进行分析,了解病毒的变化可能影响其行为和影响。

英国约克大学名誉教授瓦桑教授说:“这种RNA病毒有望进化成许多具有相同突变的独特簇,我们已经证实了这一点,并将其可视化。”

“目前,我们不认为它会影响COVID-19疫苗、治疗方法和诊断方法的开发和评估,但随着临床前和临床研究的进展,这是监测的重要信息。”

“为了实现这一目标,我们呼吁国际研究机构共享已被删除的病例严重程度和结果细节,以及其他相关的元数据,如共病和吸烟情况,以及病毒的基因组序列。”

CSIRO的澳大利亚电子健康研究中心首席执行官大卫·汉森说,这项工作表明了生物信息学、基因组学、疫苗学和病毒学等既有的学科和新兴学科交叉合作的重要性。

“遵循同行评议的公开出版物的科学过程,比如这篇论文,是CSIRO回应的一个至关重要的组成部分。”汉森博士说。

“数据可视化平台的优势在于,它突出了病毒在不断变化和适应新环境的过程中不断进化的基因突变,”鲍尔博士说,他是这篇论文的第一作者。

“我们对基因差异及其对疾病进展可能造成的后果了解得越多,我们就能更好地通过诊断和治疗来应对疾病。”

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